Então resolvi escrever como usar o ClamAV, um anti-vírus de código aberto. É claro que existe uma interface gráfica que torna tudo bem simples (Menu > Ubuntu Software Center > ClamAV), e outros anti-vírus para o Linux (http://www.makeuseof.com/tag/free-linux-antivirus-programs/) mas o objetivo aqui é usar o ClamAV pelo terminal e linhas de comando.
Para instalar:
sudo aptitude install clamavPara atualizar as informações de vírus:
sudo freshclamPara escanear todo o diretório Home e subdiretórios:
clamscan -v -r ~/Um abraço!
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